Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL41O60662 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms