Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PPLO60437 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPLO60437 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PPLO60437 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPLO60437 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPLO60437 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPLO60437 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPLO60437 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PPLO60437 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PPLO60437 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PPLO60437 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PPLO60437 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PPLO60437 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PPLO60437 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPLO60437 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPLO60437 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPLO60437 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPLO60437 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPLO60437 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPLO60437 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPLO60437 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPLO60437 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPLO60437 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPLO60437 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPLO60437 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPLO60437 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPLO60437 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPLO60437 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPLO60437 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPLO60437 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PPLO60437 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPLO60437 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPLO60437 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PPLO60437 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms