Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC28A2O43868 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC28A2O43868 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC28A2O43868 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC28A2O43868 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms