Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI1O43347 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI1O43347 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI1O43347 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI1O43347 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSI1O43347 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSI1O43347 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSI1O43347 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI1O43347 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI1O43347 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI1O43347 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI1O43347 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI1O43347 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI1O43347 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI1O43347 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI1O43347 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSI1O43347 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSI1O43347 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSI1O43347 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms