Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 NSUN5-207ENST00000478977 580 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 29.4
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RBFOX2O43251 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-209ENST00000505072 556 ntTSL 48.58□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.569e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.812e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.952e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 MGST1-216ENST00000540126 365 ntTSL 21.77□□□□□ -2.139e-22■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CATSPER2-204ENST00000409481 568 ntTSL 56.62□□□□□ -1.357e-7■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CATSPER2-210ENST00000464721 290 ntTSL 1 (best)1.77□□□□□ -2.137e-7■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 TMEM177-206ENST00000496203 881 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.281e-12■■■■■ 29.4
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RBFOX2O43251 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.451e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.451e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.511e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.531e-12■■■■■ 29.4
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RBFOX2O43251 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.138e-10■■■■■ 29.4
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RBFOX2O43251 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.858e-10■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.98e-10■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.168e-10■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 KANSL1-231ENST00000639853 1425 ntTSL 55.46□□□□□ -1.548e-10■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -14e-7■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-13■■■■■ 29.4
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RBFOX2O43251 VILL-210ENST00000488209 543 ntTSL 214.82□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 29.3
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RBFOX2O43251 VILL-209ENST00000486616 4439 ntTSL 212.02□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 29.3
RBFOX2O43251 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 29.3
RBFOX2O43251 CATSPERE-205ENST00000460986 725 ntTSL 318.4■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 29.3
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RBFOX2O43251 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 29.3
RBFOX2O43251 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 29.3
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RBFOX2O43251 CATSPERE-204ENST00000428042 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.12□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 29.3
RBFOX2O43251 CATSPERE-207ENST00000473875 2298 ntTSL 21.35□□□□□ -2.193e-7■■■■■ 29.3
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RBFOX2O43251 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 29.3
RBFOX2O43251 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 215.84■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.3
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RBFOX2O43251 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 29.2
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RBFOX2O43251 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ST3GAL6-204ENST00000462152 1102 ntTSL 213.98□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ST3GAL6-208ENST00000469105 2837 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ST3GAL6-217ENST00000486249 3148 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 SETD1A-202ENST00000452917 315 ntTSL 216.47■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ANKUB1-207ENST00000481585 431 ntTSL 34.97□□□□□ -1.619e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ADGRG6-208ENST00000472054 1247 ntTSL 24.53□□□□□ -1.684e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 ADGRG6-209ENST00000497898 715 ntTSL 1 (best)2.31□□□□□ -2.044e-8■■■■■ 29.2
RBFOX2O43251 NAALADL1-206ENST00000526516 800 ntTSL 318.99■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-209ENST00000528977 2385 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-210ENST00000529274 2427 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-214ENST00000531174 769 ntTSL 213.38□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-215ENST00000531746 1099 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-212ENST00000530139 563 ntTSL 313.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-219ENST00000533340 851 ntTSL 512.72□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 29.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 29.1
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