Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER2O15055 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER2O15055 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER2O15055 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER2O15055 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PER2O15055 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PER2O15055 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PER2O15055 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PER2O15055 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PER2O15055 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PER2O15055 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms