Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRTO14522 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
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