Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1W4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1W4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1W4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
H7C1W4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
H7C1W4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
H7C1W4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1W4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1W4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1W4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1W4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms