Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms