Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRM5B3KS81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRM5B3KS81 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms