Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms