Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms