Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPED1A4D0V7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPED1A4D0V7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms