Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAARA0A1B0GVQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAARA0A1B0GVQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms