Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 HRH2-201ENST00000231683 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 METTL1-201ENST00000257848 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PAX5-206ENST00000414447 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 Z93930.2-201ENST00000458080 505 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0CP1-201ENST00000482495 618 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CSH1-206ENST00000610991 580 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ZBTB37-202ENST00000367702 1337 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LRRC6-203ENST00000518642 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 HDAC8-201ENST00000373554 833 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KRT18P50-201ENST00000404337 1243 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC104561.2-201ENST00000523257 519 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL133299.1-201ENST00000565968 507 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CA5AP1-201ENST00000568175 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PASK-216ENST00000629419 216 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 WRNIP1-201ENST00000380764 1557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ANP32D-201ENST00000266594 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PIGQP1-201ENST00000426300 430 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL121929.1-201ENST00000457120 524 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 XIAP-AS1-201ENST00000458331 482 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC012317.1-201ENST00000563611 534 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC243830.1-201ENST00000610398 455 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL662791.5-202ENST00000623946 461 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 OR52R1-201ENST00000624978 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms