Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms