Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 VN1R64P-201ENST00000424940 933 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ATF4P3-201ENST00000433309 1056 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RN7SL217P-201ENST00000584520 286 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ANKRD20A2-203ENST00000611747 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ANKRD20A4-203ENST00000615302 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL139220.2-209ENST00000626342 826 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 LINC00694-202ENST00000634610 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC007424.1-201ENST00000552582 1641 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ANKRD20A3-201ENST00000611388 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MLN-201ENST00000266003 527 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MRGPRX1-201ENST00000302797 1190 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 NMRAL2P-201ENST00000306399 891 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 OR52I2-201ENST00000312614 1115 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 IGLV4-60-201ENST00000390284 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL732414.1-201ENST00000413346 573 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ZNF101-204ENST00000444249 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 DANT1-202ENST00000451869 444 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC139713.1-201ENST00000515019 321 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC010761.4-201ENST00000577325 521 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MXRA7-206ENST00000589082 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 FAM74A7-201ENST00000613652 727 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.160-201ENST00000622203 277 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL589826.2-201ENST00000635423 993 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 OR52I2-202ENST00000641486 1115 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RNU4-8P-201ENST00000364936 141 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL353747.1-201ENST00000404577 267 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC072022.2-201ENST00000449623 672 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SLED1-201ENST00000506741 751 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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