Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 TYRL-201ENST00000243152 441 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC073346.1-201ENST00000441928 651 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RN7SL674P-201ENST00000463397 275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AP001972.4-201ENST00000530550 560 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC051619.1-201ENST00000560007 616 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC024361.1-201ENST00000572594 642 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FAAP24-205ENST00000590281 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC067969.1-201ENST00000595853 552 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC003101.3-201ENST00000624452 768 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FHL1-229ENST00000629039 1501 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 KRTAP4-5-201ENST00000343246 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 IGKV2D-26-201ENST00000390268 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RN7SL40P-201ENST00000474689 342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AP001360.1-201ENST00000534055 518 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC023824.6-201ENST00000565523 703 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RN7SL509P-201ENST00000579670 297 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC020663.1-201ENST00000588099 556 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC027348.1-201ENST00000615979 615 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL513485.1-201ENST00000617915 845 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 PRM1-201ENST00000312511 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 KRTAP20-2-201ENST00000330798 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 KRTAP4-2-201ENST00000377726 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC007389.1-202ENST00000377977 1266 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AC007128.2-201ENST00000435967 557 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM208BQ5VWN6 LY86-AS1-203ENST00000447858 938 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms