Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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