Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms