Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RN7SL164P-201ENST00000482613 303 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PAX5-209ENST00000520154 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TSPAN16-204ENST00000590327 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MYADML-202ENST00000490394 797 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC091965.1-201ENST00000512406 440 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TREM2-201ENST00000338469 860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MYL6B-207ENST00000550443 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MYL6B-210ENST00000552568 703 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC022748.2-203ENST00000564933 1432 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 QRFPR-201ENST00000334383 1215 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 C9orf147-203ENST00000460965 446 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P24-201ENST00000476029 1046 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 RN7SL342P-201ENST00000479616 294 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC133548.2-202ENST00000562267 148 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CELF4-212ENST00000588597 1444 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 IFT22-204ENST00000437644 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AL589843.2-201ENST00000445872 1262 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ATP6V0CP1-201ENST00000482495 618 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 ABHD11-AS1-202ENST00000641969 358 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XIRP2A4UGR9 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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