Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL5Q93034 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms