Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms