Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 DEFA1-202ENST00000382692 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC008014.1-201ENST00000551503 829 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 WISP3-208ENST00000604763 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ZBTB37-202ENST00000367702 1337 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC106774.3-201ENST00000505444 169 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SIGLEC17P-201ENST00000593736 484 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC093390.2-202ENST00000638236 976 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms