Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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E2F1Q01094 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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