Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms