Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms