Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMM9Q9Y5J7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM9Q9Y5J7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms