Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB12Q9Y5F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms