Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THRAP3Q9Y2W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms