Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms