Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms