Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms