Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PHF8Q9UPP1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PHF8Q9UPP1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms