Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1LQ9UGC7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms