Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH10Q9P2E7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms