Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms