Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms