Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXL2Q9NZ53 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms