Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RDH8Q9NYR8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms