Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A4Q9NY91 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A4Q9NY91 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms