Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM1Q9NRU3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM1Q9NRU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms