Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM7Q9NR12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms