Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31BQ9NQW1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms