Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTA1Q9NP79 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms