Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA4Q9HCM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms