Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1DQ9H5J8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms