Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRABDQ9H4I3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms