Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNMDQ9H2S6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms