Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM5Q9C035 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms